敦煌研究院是国家设立的负责世界文化遗产敦煌莫高窟、全国重点文物保护单位安西榆林窟和敦煌西千佛洞保护、管理和研究的综合性专门机构。办院方针为“保护、研究、弘扬”。其前身是1944年成立的国立敦煌艺术研究所，1950年改名为敦煌文物研究所，常书鸿、段文杰先后任所长；1984年，扩建为敦煌研究院。常书鸿任名誉院长，段文杰任院长。现任领导班子成员为：院长樊锦诗，党委书记、副院长纪新民，党委副书记李金寿，党委副书记、常务副院长王旭东，副院长罗华庆。敦煌研究院设有院党委、院学术委员会、工会。院属部门有党委办公室、院长办公室、人事处、外事处、科研处、计划财务处、总务处、兰州分院办公室、保护研究所、美术研究所、考古研究所、文献研究所、民族宗教文化研究所、敦煌石窟文物保护研究陈列中心、数字中心、信息资料中心、《敦煌研究》编辑部、接待部、保卫处、榆林窟文物保管所、西千佛洞文物保管所。敦煌研究院受国家文物局委托管理古代壁画保护国家文物局重点科研基地，是国家古代壁画保护工程技术研究中心的依托单位。研究院还设有下属企业敦煌研究院文物保护技术服务中心。
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2017年9月20日，正值第二届丝绸之路（敦煌）国际文化博览会隆重召开之际，敦煌研究院在敦煌国际会展中心举行“数字敦煌”资源库英文版上线启动仪式，宣布首次向全球正式发布“数字敦煌”资源库英文版(www.e-dunhuang
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2017年4月7日上午，由中共中央党校、中共甘肃省委主办，中央党校图书馆、敦煌研究院承办的“丝绸之路上的敦煌”数字展在中共中央党校档案馆盛大开幕。
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6月3日上午，敦煌研究院在文物数字化研究所科研楼前广场，举行“饶宗颐楼”冠名揭牌仪式。中国工程院院士、香港大学前副校长、香港大学饶宗颐学术馆馆长、饶宗颐学术馆之友创会会长李焯芬，国家文物局副局长刘曙光，
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4月29日，敦煌研究院在兰州敦煌艺术馆举行举办了“数字敦煌”资源库上线新闻发布会暨启动仪式，敦煌石窟30个经典洞窟的高清数字化内容及全景漫游，通过互联网，面见世人。敦煌石窟开启了一个新的时代，全
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3月2日，敦煌研究院庆祝“三八”妇女节活动在莫高窟数字展示中心成功举办。敦煌研究院领导和各部门妇女职工，满怀喜悦，欢聚一堂，共同庆祝第106个国际妇女节。敦煌研究院党委副书记、院工会委员会主席马世林参加庆
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敦煌研究院与上海喜马拉雅美术馆签订合作协议后，开始精心筹备展览。本展览选取了8个深具敦煌艺术价值的原真复制洞窟，并同时展出经典的彩塑临摹12件、壁画临摹品（常书鸿、段文杰、常沙娜等敦煌艺术顶级大师作品）6
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素有“东方艺术明珠”之称的莫高窟是中国现存最大的石窟，为了给洞窟赢得“休养生息”时间，敦煌研究院历时4年打造的以“数字敦煌”为核心的莫高窟数字展示中心，于2014年9月正式开放运行。截至7月7日，敦煌莫高窟开
